第一步：分析题干条件。

（1）白玉隧道在彩石隧道的北边并与之相邻，在大美隧道的南边但与之不相邻；

（2）长川隧道与青山隧道之间隔一条隧道；

（3）绿水隧道与白玉隧道相邻。

由条件（1）和条件（3）可知，白玉隧道与彩石隧道相邻，并且白玉隧道在彩石隧道的北边。同时绿水隧道也和白玉隧道相邻，所以它们三者由南至北的顺序为：彩石隧道、白玉隧道、绿水隧道；由条件（1）和条件（2）可知，由于长川隧道和青山隧道之间隔一条隧道，则中间只能是大美隧道。而由于白玉隧道在大美隧道的南边，所以长川隧道、青山隧道、大美隧道都在白玉隧道的北边。

所以六条隧道由南至北的顺序有以下两种情况：

                      自南→向北

彩石      白玉      绿水      长川      大美      青山

彩石      白玉      绿水      青山      大美      长川

第二步：逐一分析选项。

A项：根据上述分析可知，彩石隧道一定在由南向北的第一位，不能推出，排除。

B项：根据上述分析可知，大美隧道一定在由北向南的第二位，可以推出，当选。

C项：根据上述分析可知，长川隧道可以在由北向南的第一位，也可以在由北向南的第三位，不能推出，排除。

D项：根据上述分析可知，青山隧道可以在由南向北的第六位，也可以在由南向北的第四位，不能推出，排除。

故正确答案为B。