第一步：整理题干条件。

（1）花花的哥哥是豆豆的好朋友；

（2）花花的哥哥在三个男生中年纪最小；

（3）毛毛的年纪比妞妞的哥哥大。第二步：根据题干条件进行推理。

题干信息确定，选项信息充分，优先考虑排除法。

根据条件（1）可知花花的哥哥不是豆豆，排除B项。根据条件（3）可知妞妞的哥哥不是毛毛，排除A项。结合条件（2）（3）可知花花的哥哥不是毛毛，排除C项。

故正确答案为D。