第一步：判断题型------本题为排列组合问题

第二步：分析作答
根据题意可知，5名员工中，男生3人，女生2人；
5人分配到三个部门，每个部门员工性别不同，因此男生必须每个部门都分配，共有 种。
再将2名女生随机分配到三个部门其中的两个，有种。
因此共有6×6=36种分配结果。

故本题选B。
【2014-黑龙江（政法干警）-070】