第一空：本空为主谓宾关系。
提取句子主干为“天文学革命_______了神学权威”，空处所填词语与“权威”搭配，表达天文学革命对神学权威的影响。

A选项“质疑”指提出疑问，文段中不仅提出疑问，而且已经发动了革命，用“质疑”语义程度过轻，排除。

B选项“铲除”指根除、彻底消灭，语义程度过重，与“权威”搭配不当，排除。

第三空：本空为主谓宾关系。
提取句子主干“_______了方法”，空处所填词语与“方法”搭配，文段强调这个方法是在“哥白尼所发动的这一场天文学革命”后产生，可知这个方法以前是没有的，是从无到有的过程。

C选项“形成”指通过发展变化而成为某种事物，侧重于从无到有的过程，符合文意，保留。

D选项“发展”指事物从出生开始的一个进步变化的过程，是事物的不断更新；文段强调的是从无到有的过程，而非从“有”到“好”的过程，排除。

第二空代入验证。
C选项“树立”指建立，“树立理性精神”搭配恰当，当选。

故本题选C。
【2017-江苏C-054】