本题为生物相关常识。
第一步：分析考点
D选项：物种多样性是指地球上动物、植物、微生物等生物种类的丰富程度，是生物多样性的核心，也是衡量生物多样性丰富程度的基本标志，当选。

第二步：分析选项
A选项：遗传多样性是指地球上生物所携带的各种遗传信息的总和，是生物多样性的重要组成部分，排除。

B选项：基因多样性是指生物种群之内和种群之间的遗传结构的变异，是生物多样性研究的重要内容，排除。

C选项：环境多样性属于生态系统多样性的范畴。生态系统多样性是指在生物圈之内的各种生态系统在不同物理大背景中发生的各种不同的生物生态进程，排除。

故本题选D。
【2016-山东-043】